下图中间红色圈出来的中性粒细胞混入了其他细胞类型,如何美化一下?

Image

代码实操

library(Seurat)
dir.create("~/gzh/20240530_umap_beautify")
setwd('~/gzh/20240530_umap_beautify')
load("~/gzh/pbmc3k_final_v4.rds")
load("~/silicosis/silicosis_cluster_merge.rds")
pbmc=All.merge#pbmc$group=ifelse(grepl(pattern = "NS",pbmc$stim),"ns","treat")DimPlot(pbmc,label = TRUE,split.by = "group")DimPlot(pbmc)

DimPlot(pbmc,pt.size = 0.8)
DimPlot(pbmc,shuffle =  TRUE,order = 'Neutrophil',pt.size = 0.8)

结果如下,我们可以看到圆圈里的点显得很均一,看上去没有其他"混杂"的点了:

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最主要就是这三个参数,你可以调调看:

我的感受

以前我对数据可视化的美观度有着极大的热情,总是追求那些看起来赏心悦目的图表。然而,回过头来看,这种美观真的那么必要吗?毕竟,数据的本质并没有因为图形的展示方式而发生改变。我们只是改变了它的表现形式而已。这种精巧的技巧不应该成为痴迷的对象,了解其存在和基本应用就足够了。